1992年12月	地铁1号线勘察设计总承包公开招标，铁道部第三勘测设计院中标。同月开始进行地铁工程预可行性研究。
1993年	成立“深圳市城市铁路客运系统（地铁）建设领导小组办公室”，挂靠市运输局，陈锡贤同志任办公室主任。
1996年	开展“深港罗湖、皇岗/落马洲口岸旅客过境轨道接驳工程”项目建议书工作，并于1997年5月向国家计委上报该项目建议书。
1997年12月	国家计委确定深圳市为地铁国产化依托城市。
1998年5月	成立“深圳市地铁工程建设办公室”，由市直机关有关部门和有关区政府的工作人员组成，在市重大项目协调领导小组的领导下开展工作，负责协调处理地铁建设过程中的问题。
1998年5月	国家计委批准“深港罗湖、皇岗／落马洲口岸旅客过境轨道接驳工程”项目建议书，工程获得立项，并更名为“深圳地铁一期工程”。
1998年7月	经市政府批准，深圳市地铁有限公司经工商注册正式成立，同时撤消“深圳市城市铁路客运系统（地铁）建设领导小组办公室” 。
1998年10月	与铁道部第三勘测设计院签订深圳地铁一期工程设计总承包合同。
1998年12月	地铁市民中心站围护结构工程与市中心区其它五大工程同时奠基开工，市五套班子的领导参加了开工仪式。
1998年10月	与中国国际工程咨询公司签订深圳地铁一期工程施工监理合同。
1999年4月	国家批准《深圳地铁一期工程可行性研究报告》，同时批准深圳地铁开工建设，一期工程包括一号线的罗湖至香蜜湖段和四号线皇岗至少年宫段，全长14.825公里，总投资79.85亿元人民币。
1999年4月	与铁道部科学研究院签订深圳地铁一期工程车辆及设备监理合同。
1999年5月	深圳地铁一期工程被列为1999年度国家重点建设项目。
1999年7月	深圳地铁一期工程初步设计完成，市规划国土局主持深圳地铁一期工程初步设计预审会，会议认为：初步设计达到了有关设计要求，投资概算修改后报市府审查。同步建设延伸段，相应增加的工程投资由市政府另行报批。
1999年10月	公司第一次召开党员大会，选举产生了中共深圳市地铁有限公司委员会。
1999年10月	市计划局、规划国土局、建设局共同组织深圳地铁一期工程初步设计评审会。会议确定了一期工程规划：19.468公里，工程投资105.85亿元。会议认为：设计符合国家有关规定、规范，工程总概算控制在国家允许的范围内，予以通过。
2000年9月	市政府决定成立“深圳市地铁工程建设指挥部”，负责工程重大事项的组织协调工作，于幼军市长担任总指挥，李德成、卓钦锐、汤耀治担任副总指挥，成员由市各有关局办领导组成。