| 1月5日 |
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| 1月20—22日 | 环保部在深圳召开会议，评审通过了“深圳市城市轨道交通9号线工程环境影响报告书技术评估报告” |
| 1月28日 | 深圳地铁三期工程建设监督服务之窗正式揭牌 |
1月，深圳北站综合交通枢纽荣获中国建筑业最高荣誉“鲁班奖”；6月，深圳北站综合交通枢纽、深圳地铁三号线两项工程获的第十一届中国土木工程詹天佑奖。 | |
| 2月5日 | 地铁集团罗湖站被团中央命名为“全国青年文明号”。 |
| 2月25日 |
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| 3月28日 |
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| 4月19日至20日 |
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| 4月28日 |
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| 5月8日 | 广东省深圳地铁集团轨道交通节能减排技术研发院士工作站的揭牌仪式在地铁大厦举行。深圳市常务副市长、陈彪副市长等领导出席了仪式。 |
| 7月6日 | 中国共产党深圳市地铁集团有限公司第二次党代会顺利召开，大会选举产生了集团公司第二届党委委员。 |
| 7月31日 | 地铁集团举办了建司十五周年系列活动，历届公司老领导参加了建司十五周年汇报会。 |
| 8月1日 | 地铁集团召开党的群众路线教育实践活动动员大会，对深入开展党的群众路线教育实践活动进行集中动员部署。 |
| 8月6日 | 深圳市发改委正式批复了轨道交通9号线工程可行性研究报告（深发改[2013]1101号）。 |
| 8月15日 | 共青团深圳市地铁集团有限公司召开第三次代表大会，大会选举产生了第三届团委委员。 |
| 8月31日 | 深圳市委召开全市质量大会，地铁集团运营分公司在2013年度市长质量奖角逐中荣获市长质量奖“鼓励奖”。 |
| 8月 | 地铁集团下属市政设计研究院有限公司在“宁波市鄞州区现代有轨电车实验线一期工程”工程可行性研究投标中一举中标，集团“走出去”战略获得重大成绩。 |
| 9月6日 | 地铁集团召开一届一次职工代表大会暨二届一次会员代表大会。大会选举产生了第二届工会委员会委员，第四届董事会职工董事、职工监事。 |
| 9月7日 | 深圳地铁首届商业地产沙龙顺利举行。 |
| 9月22日 | 深圳市地铁集团有限公司物业开发总部成立。 |
| 10月7日～10日 | 国际公共交通联合会（UITP）新加坡会议增选我司林茂德董事长为亚太分会副主席。 |
| 11月10日 | 地铁集团物业开发首发项目山海津在大中华国际交易广场盛大开盘，开盘当天共销售539套。 |
| 11月14日 | 《地铁BT投融资建设模式创建》、《运营生产信息管理系统平台的构建》、《长短交路运营行车组织》、《基于信息技术的地铁运营乘务管理与实践》和《质量过程控制管理系统的建设和应用》等5个项目获得第二十三届广东省企业管理现代化创新成果二等奖。 |
| 12月12日 | 集团公司120亿元短期融资券项目获得中国银行间市场交易商协会注册批文，12月24日成功发行2013年第一期15亿元。 |
| 12月30日 | 深圳市地铁集团有限公司运营总部成立。 |